Dentro de la Sierra Norte de Madrid contamos con numerosos arroyos y ríos que guardan una gran riqueza botánica y faunística, además de su gran valor paisajístico. Dentro de estos destacaríamos las cuencas de los ríos Lozoya y Jarama, declarados ZEC (Zona de especial conservación), dentro de la Red Natura 2000.

El cauce del río Lozoya es interrumpido por cinco embalses interconectados (Pinilla, Riosequillo, Puentes Viejas, El Villar y El Atazar), embalses que contienen una gran riqueza ornitológica, y donde se pueden practicar diferentes actividades, como piragüismo o paddel surf. La Sierra Norte fue declarada estación náutica, y el embalse del Atazar alberga instalaciones náuticas para practicar distintos deportes como la vela.